嘧啶是一种生物体中最为常见的化学物质之一，其在蛋白质、核酸等生物大分子中扮演着重要角色。
嘧啶属于范德华力相互作用体系中较为常见的一种成分，是构成核酸基础结构的重要化学物质之一。在生物体内，嘧啶还是蛋白质发生氧化反应时的重要组成部分。此外，嘧啶还在多种药物中作为活性结构单元出现。
嘧啶具有两种嘌呤、嘧啶核苷酸构成A、T、C、G基对之一，其重要性不亚于腺嘌呤。在结合了磷酸残基的核苷酸或核苷中，嘧啶成为核酸链的主要成分，成为体内重要的信息传递者。同时，嘧啶和几十种化合物结合，可以形成含嘧啶复合物， 这类化合物主要存在于一些核酸酶的活性部位， 是核酸酶水解相应的核酸链分子的前提条件。
